（一）綜合科（重慶高新區黨工委教育工作領導小組秘書組秘書科）。負責局機關收發文、保密、機要、檔案、機關財務、人事、政務公開、黨建、工會、宣傳、干部任免等工作。
（二）教育發展科。負責教育系統內外聯絡協調、教育改革和發展規劃、學校規劃布點、人事、財務、審計、經費保障、德體衛藝、技術裝備及依法履行相應的行政審批、行政檢查等工作。
（三）教育管理科（教育督導室）。負責學前教育、基礎教育、職業教育等指導和管理；負責招生、考試、學籍管理；負責中小學教材管理、課程改革、教育培訓；負責教育督導、教育質量監測及評估考核；負責民辦幼兒園及教育培訓機構審批等工作。
（四）衛生發展科。負責醫療行業管理、衛生監督管理、醫藥衛生體制改革、藥事管理、信息化建設、職業病防治、社區衛生服務體系、醫療機構規劃布點、衛生應急、緊急醫療救援、愛國衛生、義務獻血、依法履行的行政審批及行政檢查等工作。
（五）衛生管理科。負責衛健系統管理、公共衛生及疾病預防控制、老年人醫養結合、托育機構備案、計生、人口監測預警、計劃生育家庭扶助等工作。
（六）文化旅游科。負責文旅產業管理、設施建設、廣播電視、非物質文化遺產保護、文物保護、文化旅游交流合作及宣傳等工作。
（七）民政科（婚姻登記處）。負責社會組織管理、社會救助、養老服務、地名管理、婚姻登記管理、殯葬管理、特殊人群救助及慈善事業發展、福利彩票管理等工作。
（八）退役軍人科。負責退役軍人移交安置、服務管理、醫療保障和待遇發放、擁軍優屬活動、權益保護、信訪穩定和幫扶救助等工作。
（九）校外教育培訓監管科。負責面向中小學生（含幼兒園兒童）的校外教育培訓機構管理和監督工作。
（十）疾病預防控制科。負責重大疾病防治規劃、免疫規劃；完善疾控體系；組織實施食品安全風險監測、國家職業衛生；開展職業病監測防控；承擔突發公共衛生事件預防控制等工作。
